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Nature Biotechnology:北京化工大學蘇昕/劉惠玉團隊開發基因靶向識別新工具

來源:生物世界 

北京化工大學蘇昕教授和劉惠玉教授團隊在 Nature Biotechnology 期刊發表了題為:Bacteriophage λ exonuclease and a 5′-phosphorylated DNA guide allow PAM-independent targeting of double-stranded nucleic acids 的研究論文。

該研究報道了一種來自噬菌體λ外切酶(λ Exo)的新特性,它可以在引導DNA的幫助下特異性靶向雙鏈核酸序列,解決了現有技術的序列限制性與脫靶效應。

研究團隊還在期刊發表了題為:Targeting double-stranded nucleic acids using the λ Exo-pDNA system 的研究簡報,介紹了這項研究成果。

該研究通過單分子FRET(smFRET)技術證明了λ Exo在5'-磷酸化單鏈DNA(pDNA)的引導下能結合到含有pDNA互補區域的雙鏈DNA(dsDNA)或DNA-RNA duplex的機制。這種結合作用可在室溫或體溫環境下實現,且不需要任何如PAM樣的特定基序。在結合后,λ Exo在鎂離子(Mg2+)的存在下將pDNA消化成核苷酸。

利用這一特性,λ Exo-pDNA系統能夠在室溫和體溫環境中探測雙鏈基因及單核苷酸突變,還可以進行邏輯運算與信號放大。λ Exo- pDNA還可以用于基因組位點的原位熒光成像。λ Exo-pDNA系統在靶標范圍、常溫操作和序列特異性等方面,相較于現有的工具如TALEN、PfAgo和CRISPR-Cas有了顯著提升。λ Exo-pDNA系統或將成為分子診斷、DNA計算和原位成像等領域的下一代工具。

論文的第一作者為北京化工大學生命科學與技術學院博士生付勝男,通訊作者為北京化工大學生命科學與技術學院蘇昕教授,北京化工大學為論文唯一單位。